高性能计算(HPC)市场扩张非常迅速，Altera® FPGA协处理功能支持了这一市场的增长。金融、医疗成像、生物科学、军事等许多HPC市场领域都受益于Altera FPGA的逻辑和存储器资源，利用这些资源来开发专用协处理器。所有HPC市场需要协处理器来发挥性能、效能和功耗优势。在某些情况下，Altera FPGA协处理器能够将算法加速100倍以上。按照以下分类来提供解决方案：
- 应用：数据库加速，金融市场数据加速
- 功能：金融随机数发生器，军事/测试等领域的1M点快速傅立叶变换(FFT)。
- 算法：SRCs CARTE、Impulse、AutoESL
对于宽带和低延时CPU接口，合作伙伴提供基于Stratix® FPGA的Opteron HT3.0解决方案，Intel前端总线(FSB)和快速通路互联(QPI)解决方案，以及存储器DIMM接口解决方案。Stratix系列FPGA器件具有1,087K等价逻辑单元、50 Mb嵌入式存储器、66个12.5-Gbps背板兼容和24个8-Gbps高速收发器，以及3,510个18 x 18数字信号处理(DSP)模块。
最新的Stratix系列FPGA以及Stratix V FPGA支持AMD HT3.0和Intel QPI 1.1 (Stratix V GX FPGA支持)。此外，Stratix V FPGA还为PCI Express Gen3、Gen2和Gen1等协议提供目标应用器件。
浮点
在HPC中，浮点是数字表征系统，数字串(或者比特)表示一个实数。应用软件越来越多地使用浮点数据类型，以实现更精确的结果。常用的浮点应用包括：
- 快速傅立叶变换(FFT)
- 雷达
- 生物科学
- 有限冲击响应(FIR)
- 金融期权交易
- 矩阵数学
- 分子动力学
- 地震成像
- 医疗成像
